本機のリアルタイム台形補正を[オン]にしている場合、リアルタイムで台形補正を行うため、 コーナー補正で調整した値が上書きされます。

次の設定を[オフ]にした後、再度設定してみてください。 

メインメニューの「位置調整」→「リアルタイム台形補正」を[オフ]